چون قرآن یک کتاب هدایت در جممیع ابعاد زندگی است. بنابراین انتظار می رود که اصول راهنما در پژوهشهای علمی را هم بتوان از آن استنتاج نمود. ما با استنباط از قرآن کریم معتقدیم که علاوه بر اصول متعارفه منطقی ( نظیر اصل عدم تناقض( اصول زیر باید راهنمای پژوهشهای علمی قرار گیرد.
(1) اعتقاد راسخ به توحید
این اعتقاد حاکی از این است که خداوند تنها خالق و فرمانروی هستی است. همه چیز از او نشأت می گیرد و همه چیز به او ختم می شود ، و غرض از خلقت انسان این بوده که از طریق عبادت پروردگار ، خود را به او نزدیک کند :
« و ما خلقت الجن و الانس الّا لیعبدون » ( ذاریات / 56 ).
• پژوهش برای کشف طبیعت باید برای فهم عظمت صنع الهی و استفاده از امکانات فراهم شده برای انسان جهت رسیدن به سعادت ابدی باشد.
• از نظر قرآن شناخت طبیعت نباید صرفاً به خاطر ارضای حسّ ..کنجکاوی بشر باشد، بلکه باید ما را به یاد خالق طبیعت بیندازد