1- پيوند پپتيدي خاصيت پيوندهاي دوگانه را دارد. بعبارت ديگر حول محور اين پيوند چرخش به راحتي صورت نميگيرد.
2- چهار اتم تشكيل دهنده پيوند پپتيدي در يك صفحه قرار دارند.
3- چهار اتم تشكيل دهنده پيوند پپتيدي در يك خط مستقيم قرار ندارند و زنجيره به صورت زيگزاگ ميباشد.
4- اكسيژن عامل كربونيل نسبت به هيدروژن متصل به ازت در وضعيت ترانس (مقابل هم) قرار دارد.